LAMMPS实例教程—In文件详解
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实例教程—
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文件详解》
\rm 《LAMMPS实例教程—In文件详解》
《LAMMPS实例教程—In文件详解》, 针对于
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\rm Lammps
Lammps 可分析的物理过程进行讲解,提供In文件以及后处理方法,持续更新。
目前分为
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个专题:
\rm \color{Violet} 目前分为10个专题:
目前分为10个专题: 1)力学专题、2)传热专题、3)相变专题、4)界面专题、5)吸附专题、6)流动专题、7)物性专题、8)基础理论专题、9)机器学习专题、10)反应力场专题。
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博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改!
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†《LAMMPS小技巧》:
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\textbf{ \underline{\dag《LAMMPS小技巧》:}}
†《LAMMPS小技巧》: 主要介绍采用分子动力学(
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Lammps
Lammps)模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧(难度:
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††《LAMMPS实例教程—In文件详解》:
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\textbf{ \underline{\dag\dag《LAMMPS实例教程—In文件详解》:}}
††《LAMMPS实例教程—In文件详解》: 主要介绍采用分子动力学(
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Lammps
Lammps)模拟相关物理过程模拟。(包含:热导率计算、定压比热容计算,难度:
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†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:}}
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》: 主要介绍针对分子模拟的动力学过程(轨迹文件)进行后相关的处理分析(需要一定编程能力。难度:
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††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:
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††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》: 主要介绍针对后处理过程中指定函数,进行包装,方便使用者直接调用(需要一定编程能力,难度:
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†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:}}
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》: 主要介绍针对处理后的数据可视化,并提供对应的绘图模板(需要一定编程能力,难度:
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††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:}}
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》: 主要采用
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\rm Ovito
Ovito软件,对
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\rm Lammps
Lammps 生成的轨迹文件进行渲染(难度:
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\rm lammps\_materials@163.com
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† 开源后处理集成程序:请关注专栏《LAMMPS后处理——MATLAB子函数合集整理》
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† 需要付费定制后处理程序请邮件联系:
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\rm lammps\_materials@163.com
lammps_materials@163.com
建模篇:分子动力学模型快速构建
\rm 建模篇:分子动力学模型快速构建
建模篇:分子动力学模型快速构建
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\rm \color{red} Material\ Studio+Moltemplate+Packmol
Material Studio+Moltemplate+Packmol
1、 建模篇(上):OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate
2 、建模篇(下):力场快速设置-AuToFF+Moltemplate
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Lammps
Lammps 后处理及编程技巧第一次线上分享论坛(
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文章目录
LAMMPS实例教程—In文件详解
建模篇:分子动力学模型快速构建
\rm 建模篇:分子动力学模型快速构建
建模篇:分子动力学模型快速构建1、 [建模篇(上):OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate](https://blog.csdn.net/qq_43689832/article/details/127913687)2 、[建模篇(下):力场快速设置-AuToFF+Moltemplate](https://blog.csdn.net/qq_43689832/article/details/137957981)
1.
力学专题
1. 力学专题
1.力学专题1. Lammps之纳米压痕(包含in文件)2. 石墨烯复合材料单轴压缩-应力应变曲线以及弹性模量计算(包含in文件)3. Lammps剪切作用的两种实现方法及对比—Deform以及Velocity4. 有趣的纳米“通道”—Lammps实现循环不同压痕深度5. Lammps切削过程实现以及工件表面识别(包含in文件)6. Lammps模拟剪切作用下的位错滑移
2.
传热专题
2. 传热专题
2.传热专题1. LAMMPS非平衡分子动力学 (NEMD) 纳米线热导率教程—一个代码循环计算不同温度和尺寸2. 漫谈分子动力学计算热导率的五种方法
3.
相变专题
3. 相变专题
3.相变专题1. Lammps实现结冰匀相成核2. Lammps实现Ar的沸腾过程(包含in文件)3. Lammps实现随机粗糙度表面的沸腾现象4. Ar在三维粗糙结构表面的沸腾过程5. Lammps实现定向结冰成核通道
4.
界面专题
4. 界面专题
4.界面专题1. Lammps不同亲疏水性粗糙表面的润湿行为模拟(包含in文件)2. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(一)3. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(规则粗糙表面)(二)4. 一个代码循环计算水在石墨烯表面的接触角5. 纳米颗粒包覆结构的模型构建技巧
5.
吸附专题
5. 吸附专题
5.吸附专题
1.
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实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为
\sout{1. Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为}
1.Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为2. Lammps实现甲烷与水的竞争吸附3. 巨正则蒙特卡洛—甲烷和二氧化碳的竞争吸附GCMC4. Lammps压力控制之活塞控压—一个代码循环限域空间内的气体分子数
5.
多孔氧化硅结构模型构建
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\sout{5. 多孔氧化硅结构模型构建-复现(Journal of Physical Chemistry B)}
5.多孔氧化硅结构模型构建−复现(JournalofPhysicalChemistryB)(调整中)
6.
流动专题
6. 流动专题
6.流动专题1. 不同速度、不同压力环境中的液滴对撞—一个代码循环速度和压力(氮气分子数)2. Lammps实现纳米孔道内的气体流动(未完成)3. Lammps实现纳米孔道内瓦斯驱替过程(包含In文件)
7.
物性专题
7. 物性专题
7.物性专题1. Lammps之循环定压比热熔计算2. Lammps之MP方法粘度计算(包含in文件)
8.
基本理论专题
8. 基本理论专题
8.基本理论专题1. 基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动2. 聊聊有趣的布朗运动3. 学习麦克斯韦-玻尔兹曼分布速度分布
9.
机器学习专题
9. 机器学习专题
9.机器学习专题1. 基于GPUMD的NEP机器学习势函数—二氧化硅融化
10.
反应力场专题
10. 反应力场专题
10.反应力场专题Continue...
1.
力学专题
1. 力学专题
1.力学专题
1. Lammps之纳米压痕(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-01-13,该博文由
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\rm Dr.BINBO
Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
2. 石墨烯复合材料单轴压缩-应力应变曲线以及弹性模量计算(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-03-16,该博文由
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\rm Dr.BINBO
Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
3. Lammps剪切作用的两种实现方法及对比—Deform以及Velocity
(请点击跳转)更新于2022-03-20,该博文由
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\rm Dr.BINBO
Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
4. 有趣的纳米“通道”—Lammps实现循环不同压痕深度
(请点击跳转)更新于2022-03-27,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. Lammps切削过程实现以及工件表面识别(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-05-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
6. Lammps模拟剪切作用下的位错滑移
(请点击跳转)更新于2022-10-11,该博由 Binbo 提供(lammps_materials@163.com)。
2.
传热专题
2. 传热专题
2.传热专题
1. LAMMPS非平衡分子动力学 (NEMD) 纳米线热导率教程—一个代码循环计算不同温度和尺寸
(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. 漫谈分子动力学计算热导率的五种方法
(请点击跳转)更新于2022-04-14,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3.
相变专题
3. 相变专题
3.相变专题
1. Lammps实现结冰匀相成核
(请点击跳转)更新于2022-04-21,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现Ar的沸腾过程(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-04-27,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现随机粗糙度表面的沸腾现象
(请点击跳转)更新于2022-05-08,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. Ar在三维粗糙结构表面的沸腾过程
(请点击跳转)更新于2023-01-08,该博由 Dr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. Lammps实现定向结冰成核通道
(请点击跳转)更新于2022-12-01,该博由 Dr.Fairy 提供(lammps_materials@163.com)。
4.
界面专题
4. 界面专题
4.界面专题
1. Lammps不同亲疏水性粗糙表面的润湿行为模拟(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(一)
(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(规则粗糙表面)(二)
(请点击跳转)更新于2022-05-15,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. 一个代码循环计算水在石墨烯表面的接触角
(请点击跳转)更新于2023-03-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. 纳米颗粒包覆结构的模型构建技巧
(请点击跳转)更新于2023-05-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5.
吸附专题
5. 吸附专题
5.吸附专题
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实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为
\sout{1. Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为}
1.Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为
(暂不开源)
\color{red}(暂不开源)
(暂不开源)
(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现甲烷与水的竞争吸附
(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. 巨正则蒙特卡洛—甲烷和二氧化碳的竞争吸附GCMC
(请点击跳转)更新于2022-04-2,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. Lammps压力控制之活塞控压—一个代码循环限域空间内的气体分子数
(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5.
多孔氧化硅结构模型构建
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\sout{5. 多孔氧化硅结构模型构建-复现(Journal of Physical Chemistry B)}
5.多孔氧化硅结构模型构建−复现(JournalofPhysicalChemistryB)(调整中)
(请点击跳转)更新于2023-05-12,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
6.
流动专题
6. 流动专题
6.流动专题
1. 不同速度、不同压力环境中的液滴对撞—一个代码循环速度和压力(氮气分子数)
(请点击跳转)更新于2022-01-30,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现纳米孔道内的气体流动(未完成)
(请点击跳转)更新于2022-09-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现纳米孔道内瓦斯驱替过程(包含In文件)
(请点击跳转)更新于2022-11-12,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
7.
物性专题
7. 物性专题
7.物性专题
1. Lammps之循环定压比热熔计算
(请点击跳转)更新于2021-11-10,该博文由
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\rm Dr.Xian
Dr.Xian 提供(
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\rm Victor\_Xian285@163.com
Victor_Xian285@163.com)。
2. Lammps之MP方法粘度计算(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-01-10,该博文由
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\rm Dr.Xian
Dr.Xian 提供(Victor_Xian285@163.com)。
8.
基本理论专题
8. 基本理论专题
8.基本理论专题
1. 基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动
(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. 聊聊有趣的布朗运动
(请点击跳转)更新于2022-04-25,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. 学习麦克斯韦-玻尔兹曼分布速度分布
(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
9.
机器学习专题
9. 机器学习专题
9.机器学习专题
(请点击跳转)更新于2022-12-03,该博由 Mr.Maple 提供(lammps_materials@163.com)。
1. 基于GPUMD的NEP机器学习势函数—二氧化硅融化
10.
反应力场专题
10. 反应力场专题
10.反应力场专题
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